近期，有网友问，所得税中的成本分摊协议，此业务需要缴纳增值税吗？先来了解一下企业所得税中的成本分摊涉及文件及规定。
《中华人民共和国企业所得税法》（中华人民共和国主席令第63号）第四十一条第二款规定，企业与其关联方共同开发、受让无形资产，或者共同提供、接受劳务发生的成本，在计算应纳税所得额时应当按照独立交易原则进行分摊。
《中华人民共和国企业所得税法实施条例》（国务院令2007年第512号）第一百一十二条规定，企业可以依照企业所得税法第四十一条第二款的规定，按照独立交易原则与其关联方分摊共同发生的成本，达成成本分摊协议。
企业与其关联方分摊成本时，应当按照成本与预期收益相配比的原则进行分摊，并在税务机关规定的期限内，按照税务机关的要求报送有关资料。企业与其关联方分摊成本时违反本条第一款、第二款规定的，其自行分摊的成本不得在计算应纳税所得额时扣除。
《特别纳税调整实施办法（试行）》（国税发[2009]2号）第六十八条对于成本分摊协议的相关规定。
成本分摊协议是企业所得税概念，增值税中并无分摊之说。企业与其关联方共同开发、受让无形资产，或者共同提供、接受劳务发生的成本时，增值税如何正确处理呢？下面作以简要分析。
例1：2018年初，甲、乙两家公司（关联企业）共同研发某项专利技术，并达成成本分摊协议。至2018年末，甲公司为此发生的研发支出100万元，乙公司发生200万元。甲、乙约定的成本分摊比例4：6，当年实际总支出300万元，则：甲公司应向b公司支付20万元的成本费用。
假设：甲公司研发支出100万元中，取得增值税专用发票50万元，进项税额8万元；乙公司研发支出200万元中，取得增值税专用发票100万元，进项税额16万元。且均已分别在甲乙公司予以抵扣。
1.不论该项专利技术是否研发成功，不论该项专利技术研发成功后是用于本企业生产经营还是对外转让，按增值税暂行条例第八条、第十条等相关规定，企业正常列入期间费用的研发支出、形成无形资产用于本企业产品连续生产使用的或对外转让的，可以从销项税额中抵扣。
2.按成本分摊协议，甲向乙支付了20万元，甲乙公司的实际支出发生了改变，乙公司实际支出减少了20万元，那么，20万元中对应的进项税额如何处理呢？按目前增值税相关规定，因不是经营业务，不属于增值税应税范围，乙公司收取的20万元，并不能开票及计提销项税额。也没有发生需作进项转出或不得抵扣的情形。
3.如果甲公司很少发生经营业务，因购置了写字楼而账面有大量留抵税额，则会将能取得增值税专用发票的设备材料购置业务放在乙公司，再按分摊协议支付给乙公司价款。
4.专利技术研发成功后，由甲公司对外转让1000万元，免征增值税。分给乙公司600万元，乙公司实际获利420万元（600-200+20）。且乙公司比甲公司多得到了8万元的进项抵扣。
5.专利技术研发成功后，由甲公司对外转让1060万元，假设不予免征增值税，甲公司全额向购买方开具增值税专用发票、计提销项税额60万元。乙公司实质上将其拥有的60%部分委托甲公司一并处置，则乙公司收取600万元价款，开具增值税专用发票给甲公司，计提销项税额36万元。
例2：2018年9月2日，甲、乙两家公司（关联企业）共同受让某项专利技术300万元，用于生产经营，甲、乙共同与专利技术提供方签订协议。甲乙两家公司另外达成成本分摊协议，甲、乙约定的成本分摊比例4：6。
1.如果甲、乙分别向技术提供方支付120万元、180万元，技术提供方可以分别开具增值税专用发票给甲、乙公司；
2.如果甲公司支付了300万元，技术提供方只向甲公司开具了300万元增值税专用发票。甲按照分摊协议和乙实际使用该专利技术等事实，可以向乙开具180万元增值税专用发票，并收取款项、计提销项税额。
3.专利技术在甲乙两家公司的使用，准确界定预期收益比例其实相当困难，间接参考指标还会受其他诸多因素影响。所以，分摊比例的自由度比较大，关联方筹划税收利益的空间是存在的。
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