水产养殖中由于集约化的养殖方式，养殖水域受到不同程度的水质污染，水质发生污染，会导致各种微生物细菌大量繁殖，各种原因水中微生物超标容易对养殖造成严重的危害，导致养殖鱼虾发病，引起大面积死亡等严重后果，水产养殖中，消毒剂是必不可少的。消毒剂可以杀灭水中微生物，净化水质，消毒剂在水产养殖中被广泛使用。
水产养殖中常用的几种消毒剂：
漂白粉漂白粉一般适用于清塘时道毒：漂白粉可以杀死水体中的生物，不适于养殖时期使用；
高锰酸钾用作消毒剂、除臭剂、水质净化剂。高锰酸钾为强氧化剂，遇有机物即放出新生态氧而且有杀灭细菌作用，杀菌力极强，但极易为有机物所减弱，故作用表浅而不持久。
生石灰生石灰在干燥状态无消毒杀菌作用，当石灰接触到湿的物体才能显示碱性才具有杀菌的作用，生石灰在使用时，使用不当会起反作用。
过硫酸氢钾是强氧化剂，可以中和亚硝酸盐，一般用作消毒改底。
杀菌效果强，见效快，消毒作用强。可以杀水体中的藻类，使用不当可能会出现倒藻。
甲醛类消毒剂甲醛类消毒剂一般是在清塘时使用，因为它的挥发性强使得池底不会有残留物，因而成为养殖户们清塘的选择之一。值得注意的是，甲醛不能用金属容器储存，应该用有色玻璃进行密封保存并放置于阴凉处。
二氯海因二氣海因含氯含量高，气味轻，作用温和，杀菌所需浓度高，作用时间较长，有效氯释放缓慢。
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